Villa San Carlo Borromeo má bohatou historii. V 8. století před naším letopočtem na tomto místě byla keltská osada, s Juliusem Caesarem - základem Římanů. Postavili silné opevnění, které zůstaly dlouho nedobytné. Následně, Longobards převzali pevnost, dokud nakonec v XIV století tato země nevzala k Visconti rodině. Na jejich objednávku byl postaven krásný renesanční palác.

Rodina Borromeo se poprvé objevila v historii vily na konci 17. století v souvislosti s dynastickým sňatem: Federico Borromeo si vzal Veroniku Viscontiovou. Federico se rozhodl znovu postavit panství. Syr otce Gilberta pokračoval ve věci. On také objednal nové nastavení pro vilu. Na druhém místě byl jeho syn Saint Carlo Borromeo, nejslavnější zástupce slavné rodiny. Boromeo vlastnil vily až do poloviny XX. Století. Aristokraté měli rozsáhlé kontakty. Například ve století XVIII-XIX byli Diderot a Stendal častými hosty ve vile.

Během druhé světové války byla budova a park velmi zničeny a dlouhodobě se zhoršily. V roce 1983 byla tato nemovitost zakoupena italskou organizací Università internazionale del secondo rinascimento, která našla finanční prostředky na restaurování. Interiéry byly obnoveny, zaměřené na archivní kresby. Situace zvedla vícestranné, většinou starožitnosti. Vila se nyní používá jako hotel a jako malé soukromé muzeum. Oslavy jsou také organizovány zde.